用气味来标记领土是大熊猫在竹林里保持和平的秘诀。大熊猫将肛周腺体的分泌物涂在柱子、树桩、墙上、地上以及它们经常经过的地方。这些气味标记能让它们互相回避或聚到一起。在非发情季节的时候，一闻到陌生熊猫的气味它们就会走开。发情季节的时候，一只雌性大熊猫的气味可能就表示她已经做好交配的准备，并且希望吸引雄性前来。
大熊猫有好几种做标记的方式。它们经常用尿液，或尿液和肛周腺分泌物的混合来做标记。当它们做标记的时候，它们会晃动头部，嘴巴半张。做了标记以后，它们会在做标记的地方剥掉树皮，或留下抓痕，以引起其他大熊猫的注意。